Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc97Q9DBT3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc97Q9DBT3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc97Q9DBT3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms