Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tysnd1Q9DBA6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms