Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smdt1Q9DB10 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smdt1Q9DB10 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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Smdt1Q9DB10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Smdt1Q9DB10 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Smdt1Q9DB10 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smdt1Q9DB10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms