Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9W1

Pifo, Protein pitchfork, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PifoQ9D9W1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PifoQ9D9W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PifoQ9D9W1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms