Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Q9D9H8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Q9D9H8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9D9H8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Q9D9H8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Q9D9H8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9D9H8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9D9H8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Q9D9H8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms