Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmco5aQ9D9D5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms