Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
1700123K08RikQ9D991 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
1700123K08RikQ9D991 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
1700123K08RikQ9D991 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms