Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnot8Q9D8X5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cnot8Q9D8X5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms