Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chmp5Q9D7S9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chmp5Q9D7S9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms