Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ttc9bQ9D6E4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ttc9bQ9D6E4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc9bQ9D6E4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms