Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2al3Q9D4U4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2al3Q9D4U4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2al3Q9D4U4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms