Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc105Q9D4K7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc105Q9D4K7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc105Q9D4K7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms