Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lonrf3Q9D4H7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lonrf3Q9D4H7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms