Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9D2Q3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q9D2Q3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9D2Q3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms