Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dnaaf1Q9D2H9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dnaaf1Q9D2H9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms