Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Necap2Q9D1J1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Necap2Q9D1J1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Necap2Q9D1J1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms