Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hddc3Q9D114 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hddc3Q9D114 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms