Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pbdc1Q9D0B6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pbdc1Q9D0B6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms