Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Elp3Q9CZX0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elp3Q9CZX0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elp3Q9CZX0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms