Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl55Q9CZ83 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mrpl55Q9CZ83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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