Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rbm8aQ9CWZ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rbm8aQ9CWZ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rbm8aQ9CWZ3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms