Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY3

Setd6, N-lysine methyltransferase SETD6, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd6Q9CWY3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Setd6Q9CWY3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Setd6Q9CWY3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Setd6Q9CWY3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms