Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ly6kQ9CWP4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ly6kQ9CWP4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ly6kQ9CWP4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms