Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Sycp2Q9CUU3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
Sycp2Q9CUU3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Sycp2Q9CUU3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Sycp2Q9CUU3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms