Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sppl3Q9CUS9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sppl3Q9CUS9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sppl3Q9CUS9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms