Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pard3bQ9CSB4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pard3bQ9CSB4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pard3bQ9CSB4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms