Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029F12RikQ9CRB4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029F12RikQ9CRB4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms