Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atp5sQ9CRA7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp5sQ9CRA7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms