Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NmbQ9CR53 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NmbQ9CR53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NmbQ9CR53 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms