Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PompQ9CQT5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PompQ9CQT5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PompQ9CQT5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms