Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3bQ9CQE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms