Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chchd1Q9CQA6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chchd1Q9CQA6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chchd1Q9CQA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms