Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nudcd2Q9CQ48 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nudcd2Q9CQ48 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms