Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab27bQ99P58 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab27bQ99P58 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms