Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdac9Q99N13 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hdac9Q99N13 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hdac9Q99N13 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms