Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a6cQ99N08 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ms4a6cQ99N08 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms