Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU8

Uncharacterized protein C6orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99LU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q99LU8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q99LU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q99LU8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q99LU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q99LU8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q99LU8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q99LU8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q99LU8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q99LU8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q99LU8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q99LU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q99LU8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99LU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99LU8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99LU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99LU8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q99LU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms