Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF1

Akirin1, Akirin-1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akirin1Q99LF1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akirin1Q99LF1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akirin1Q99LF1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Akirin1Q99LF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms