Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cds2Q99L43 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cds2Q99L43 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cds2Q99L43 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms