Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Arrdc1Q99KN1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Arrdc1Q99KN1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Arrdc1Q99KN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms