Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dok4Q99KE3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Dok4Q99KE3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dok4Q99KE3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms