Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctu1Q99J10 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctu1Q99J10 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctu1Q99J10 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms