Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Slc8b1Q925Q3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Slc8b1Q925Q3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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