Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ripply3Q924S9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ripply3Q924S9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms