Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn1Q922Y1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn1Q922Y1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn1Q922Y1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms