Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SncbQ91ZZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SncbQ91ZZ3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SncbQ91ZZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms