Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx18Q91ZR2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx18Q91ZR2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms