Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cbx7Q8VDS3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cbx7Q8VDS3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cbx7Q8VDS3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms