Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1Q8VDF2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Uhrf1Q8VDF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Uhrf1Q8VDF2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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