Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ubxn4Q8VCH8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ubxn4Q8VCH8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ubxn4Q8VCH8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms